تبتعد القرية عن الرملة 12.5 كيلومتر
كانت القرية قائمة على رقعة مستوية من الأرض في السهل الساحلي الأوسط على الطرف الشمالي لوادي الصرار الذي يأتي بمياه الأمطار من جبال القدس إلى البحر الأبيض المتوسط (حيث يعرف باسم نهر روبين). وكان الطريق العام الذي يصل غزة بطريق الرملة-القدس العام يمر جنوبي أم كلخة. وقرب القرية كانت محطة سكة حديد وادي الصرار تصل أم كلخة بخط سكة حديد وادي الصرار تصل ام كلخة بخط سكة الحديد الممتد بين الرملة والقدس.
من العسير تحديد تاريخ احتلال أم كلخة وكيفيته إذ من الجائز أن تكون احتلت في النصف الأول من أبريل/ نيسان 1948 أثناء عملية نتحشون أو سياق عمليات المتابعة الصغيرة التي عقبت العملية التي نجحت في الاستيلاء على معظم القرى الواقعة في ممر القدس.
في عام 1948 أنشئت مستعمرة يسودوت على أراضي القرية.