تقع قرية مجدل بني فاضل في وسط فلسطين، في الجزء الشمالي الشرقي من الضفة الغربية،إلى الجنوب من مركز مدينة نابلس بحوالي 18 كم. وتبلغ مساحتها قرابة 28000 دونم، تشكل المساحة العمرانية منها قرابة 160 دونم.يحيط بها من الشرق قريتي الجفتلك ومن الشمال بلدة عقربا، ومن الغرب بلدة قصرة، أما من الجنوب فيحدها قرية دوما.