تم اكتشاف مقبرة من العصر البرونزي المتوسط في عام 1934،  تم العثور على شقف فخارية من الفترة الهلنستية والأموية / العباسية . 

 عرفت عين قينيا تقليدياً بAinqune خلال الفترة الصليبية، وهي واحدة من الإقطاعات التي قدمها الملك جودفري إلى كنيسة القبر المقدس. ^.

 ومع ذلك، يقول فينكلشتاين أنه يجب إعادة النظر في هذا التعريف. تم العثور على شقف فخارية من العصر المملوكي أيضا.