تمتاز البيوك بمناخ شبه صحراوي كونها تقع على مشارف صحراء النقب، وهي منطقة كثيرة الكثبان الرملية من ناحية، ومن منخفضة نسبياً عن مستوى سطح البحر، ومن ناحية أخرى هي ليست بالبيعدة عن المناخ المتوسطي الذي تأثر به مدينة رفح ومناطق جنوبي القطاع، وبالتالي فهي تتأثر بكلا المناخين.