رجّح بعض الباحثين إلى أنّ أصل التّسمية يعود إلى “مصر”، حيث ينسب الباحثون تأسيس القرية المعاصرة إلى عائلات مهاجرة من مصر إبّان فترة حكم علي باشا خلال القرن التّاسع عشر (1768 – 1849). كما يبدو، خلال فترة الانتداب لم تتواجد في القرية أيّة عائلة مصريّة، حيث كان جميع السّكّان من عائلة الزّعبيّة.
 أمّا خلال العصور القديمة، فقد رجّح الباحثون أن يكون أصل التّسمية، يعود إلى استيطان المصريّين القدامى في المنطقة عام 605 ق.م إبّان فترة الفرعون نخاو الثّاني (610 – 595 ق.م). كما ورد اسم “كفر مصر” في المصادر الصّليبيّة، بينما ورد اسم القرية في خارطة “جاكوتين” من عام 1799، تحت اسم “Mebhel” بمعنى المكان الخلّاب/الجميل.
 لاحقًا ورد ذكرها في سجلّ الضّرائب من الفترة العثمانيّة (تحت اسم Misrasafa) على أنّها تابعة إلى لواء صفد، بينما ذكرت باسم “كفر مصر” ضمن المسح الذي قامت به جمعيّة مسح فلسطين عام 1888 (PEF – Palestine exploration fund). كما ووصفها الرّحالة فيكتور جيرن خلال زيارته للموقع عام 1875.