يعد موقع قرية دير قديس واحد من المواقع الأثرية القديمة والتي لاتزال تحتفظ ببعض معالم الأزمنة التي مرت عليها، كبقايا المباني الحجرية، والخرب وغيرها، وفي أراضي دير قديس عثر على الخرب التالية: 

• خربة الجردة: تبعد نحو كيلومترين للشرق من القرية. محتوياتها: «أساسات وجدران وصهاريج.
• خربة السيار: تقع في الجهة الشمالية الغربية من القرية.
• خربة دير الجدي: تقع في الجهة الغربية من دير قديس وعلى مسيرة نحو نصف كيلومتر.
• خربة الحبس أو الحبيس: محتوياتها: «غرفة منحوتة في الصخر ومدافن وبركة ونحت في الصخور.