فرعم موقع أثري هام وفي الغالب أن القرية الحديثة بنيت فوق فرعم الكنعانية القديمة، وربما دلت الآثار والمعالم الآثرية الموجودة في موقع القرية على هذا حيث يوجد في موقع القرية: بقايا أبنية قديمة، مدافن منقورة في الصخر، مغر، معاصر، وصخور منحوتة.

إلى جانب الخربتان القديمتان اللتان كانتا تقعان في جوار القرية، هما:

1. خربة عين البستان: كانت تقع شمالي القرية، وتزيدها ارتفاعاً (ترتفع الخربة حوالي 700م عن مستوى سطح البحر)، كان فيها أنقاض أبنية قديمة وأكوام من الحجارة.
2. خربة الشيخ بنيت: تقع في منتصف الطريق بين قريتي فرعم وعموقة وتزيدهما ارتفاعاً (ترتفع حوالي 879م عن مستوى سطح البحر)، كانت تحتوي أيضاً أنقاض أبنية قديمة ومدافن.