تقع قرية عين رافا ١٣ كيلومتر غربي القدس، سكانها الأصليين جاءوا من قرية صوبا المهجرة بعد هروبهم من قريتهم على أثر مذبحة دير ياسين القريبة منهم. 

تفرق سكان صوبا قسم الى الضفة وقسم آخر الى الأردن بعد عدة اشهر عاد قسم كبير منهم الى قرية صوبا، ولم يستطيعوا العودة الى قريتهم الاصلية صوبا فبدأوا بالاستقرار في أراضيهم الزراعية في قرية عين رافا. 

لا زال يوجد اثار لبعض البيوت القديمة التي بنيت مع قيام القرية.