كانت قرية المزار من بين قرى جنين التي قُدِرَ لها الاختلال خلال حرب 1948، ويذكر المؤرخ وليد الخالدي نقلاً عن مصادر عبرية أن قرى المزار ونورس وزرعين تم احتلالها وتهجير أهلها منها إثر هجوم نفذه جنود من الكتيبة الرابعة في لواء جفعاتي وذلك ضمن عملية عرفت باسم "غدعيون" وذلك يوم 30 أيار/ مايو 1948.