تاريخياً كانت جنين مركز لقضاء يحمل اسمها ويتبع له عدد كبير من القرى.

وعندما استلمت السلطة الفلسطينية سنة 1995 رسمياً إدارة بلدات وممدن الضفة الغربية، اعتمدت تقسيماً إدارياً جديداً في بعض المدن ورسمياً تم اعتماد اسم محافظة بدلاً من قضاء على مراكز المدن، وهو حال مدينة جنين التي بات اسمها محافظة جنين رسمياً منذ ذلك العام.

تقدر مساحة محافظة جنين بشكل عام 583000 دونم، وتوزع هذه المساحة على مدينة جنين ذاتها، ومخيمها، و 91 قرية وبلدة وتجمع.

المساحة المذكورة لا تتضمن مساحة 6 قرى مهجرة سنة 1948، و 10 قرى من قضاء جنين ألحقت بأراضي الـ 48