بلغت نسبة الأمية لدى سكان قرية كفر قليل عام 2007، حوالي 4.8 %، وقد شكلت نسبة الإناث منها 79.7 %. ومن مجموع السكان المتعلمين، كان هناك 18.2 % يستطيعون القراءة والكتابة، 32.5 % انهوا دراستهم الابتدائية، 22.1 % انهوا دراستهم الإعدادية، 13.5 % انهوا دراستهم الثانوية، و 8.5 % انهوا دراستهم العليا.

يوجد في القرية مدرستين حكوميتين، ويتم إدارتهما من قبل وزارة التربية والتعليم العالي الفلسطينية

يبلغ عدد الصفوف الدراسية في قرية كفر قليل 22 صفا، وعدد الطلاب 541 طالبا وطالبة، وعدد المعلمين 35 معلما ومعلمة 

كما يوجد في قرية كفر قليل روضة واحدة للأطفال، تشرف على إدارتها جهة خاصة.

وفي حال عدم توفر إحدى المراحل التعليمية في التجمع ، كالمرحلة الثانوية للذكور بجميع فروعها في مدارس القرية، فان الطلبة يتوجهون للدراسة في مدارس مدينة نابلس، والتي تبعد عن القرية حوالي 5 كم، بالإضافة إلى عدم توفر الفرع التجاري للإناث في مدارس القرية، لذلك فإن الطالبات يتوجهن للدراسة في مدرسة الصلاحية للإناث في مدينة نابلس، والتي تبعد عن القرية حوالي 5 كم

يواجه قطاع التعليم في قرية كفر قليل بعض العقبات والمشاكل منها:

قدم أبنية مدارس القرية، حيث أصبحت مدرسة الذكور آيلة للسقوط. 

قلة عدد المعلمين في مدارس القرية .