تتوفر في قرية كفر القليل من المرافق الصحية، حيث يوجد عيادة طبيب عام خاصة، وصيدلية خاصة. وفي حالات الطواريء يتوجه المرضى إلى مستشفى رفيديا الحكومي والمستشفى الوطني الحكومي ومستوصف الرحمة الخاص والعيادات الخاصة في مدينة نابلس، و الذين يبعدون عن القرية حوالي 5 كم

كما يواجه القطاع الصحي في قرية كفر قليل مشكلة هامة تتمثل في عدم وجود مركز صحي في التجمع لخدمة سكانه