يُعتبر الاسم فرعون في اللغة السامية  وخاصة اللهجة الكنعانية هو كفار عون (قرية عون)، ثم أسقط حرف الكاف كما هو معتاد في اللهجات السامية للتخفيف، أو أن التسمية فياللهجة الأرامية كانت برعون بمعنى السيد (السيد عون) مع العلم أن المصادر والمراجع التاريخية لا تعلل التسمية لهذا البلد وخاصة 

 ولا تبتعد الروايات الشفوية الشائعة بين سكان البلدة عن تلك الاحتمالات فيما يتعلق بالتسمية، كما أنها قرية آرامية الأصل ثم تحولت إلى قرية مسيحية في الفترة الرومانية، أما في الفترات الإسلامية فتم تقسيم القرية - خاصة ما يعرف بمنطقة نصف جبيل حوالي 2 كيلومتر جنوب شرق القرية – من قبل السلطان المملوكي الظاهر بيبرس بين اثنين من قادته، وفي العصر العثماني كانت جزءاً من سنجق القدس، أما في العهد البريطاني فكانت جزءاً منقضاء طولكرم، وفي فترة ما بعد العهد الأردني وما بعد النكسة  كانت جزءاً ضمن «لواء طولكرم»، ثم ضمن مسمى محافظة طولكرم عقب أوسلو.