بعد عشرين عامًا من القرار الصهيوني ، وخلال أوسلو، بدا أن الجيش الصهيوني والمستوى السياسي يعمل على تحقيق واقع مفروض على الأرض يساهم في الحصول على مساحات من الأراضي الفارغة خاصةً على تخوم الخط الأخضر. لذلك سلم الجيش الصهيوني في آب/ أغسطس وتشرين ثاني/ نوفمبر 1999 غالبيّة سكان القرى 12 إخطارات بإخلاء منازلهم بذريعة "السكن غير القانوني في منطقة إطلاق نار"، استنادًا إلى ادعاء أن سكان مسافر يطا لا يقيمون بشكلٍ دائم في المكان وأن المنطقة مهمة للحفاظ على "الكفاءة المطلوبة لقوات الجيش الصهيةني"، ولذلك يمكن إعلانها منطقة إطلاق نار وتهجير سكانها، أما السكان فيرفضون الادعاء الإسرائيلي.

 في 16 من تشرين ثاني/ نوفمبر 1999، نفذت القوات الصهيونية قرارها، وقامت بتهجير أكثر من 700  شخص من سكان مسافر يطا، وهدمت المنازل، وردمت الآبار والكهوف، وقامت بمصادرة الأغنام وإتلاف الأراضي الزراعية، ضمن خطتها من أجل إفراغ المكان. فيما كان رد أهالي مسافر يطا العودة إلى الأرض التي هجروا منها والسكن في الخيام والكهوف التي عاشوا فيها قبل أقل من 100 عام.