اختلف الباحثون في أصل تسمية القرية، فكلمة العنان لغوياً تعني الارتفاع، وقد أطلق عليها الشهيد المجاهد عبد القادر الحسيني  لقب «بيت الأمان» لاحتضان القرية له ولجوءه إليها عدة مرات إبانالنكبة  ويُرجح أن تكون التسمية عائدة إلى اسم الشيخ «حسين عنان» الذي سكن القرية مع موجات الفتح الإسلامي لفلسطين. وهذه هي النسبة الصحيحة حسبما أورد الدكتور جاسر العناني في كتابه «بيت عنان أرض وتاريخ». ومما يذكره الدكتور العناني في هذا الكتاب أن المقام الموجود في جبل تعود بنا إلى حقب زمنية بعيدة تصل إلى جذورها إلى الفترات الكنعانية، وهذا ما يؤكده ناصر جمهور في بحثه عن آثار القرية وهي كما جاءت في مقالته «أهم الخرب والآثار في أراضي بيت عنان»؛ إن للقرية جذور تعود لفترات تمتد إلى ما قبل 3000 عام.