لمدينة قلقيلية موقع جيواستراتيجي هام لعدة أسباب:

• قربها من ثلاث محافظات هامة هي: محافظة طولكرم على مسافة 14 كم، محافظة نابلس على مسافة 26 كم، محافظة سلفيت على مسافة 22 كم.
• مرور الخط الأخضر (خط الهدنة) على أراضي قلقيلية وهو الذي يفصل بين قرى وبلدات الضفة الغربية والقرى الفلسطينية المحتلة عام 1948.
• ومنذ أن شرعت سلطات الاحتلال ببناء جدار الفصل العنصري منذ عام 2002 قضم هذا الجدار 1836 دونم من أراضي القرية من جميع الجهات.

هذا الموقع الهام والحساس في ذات الوقع يجعل المدينة معرضة بشكل دائم لاعتداءات المستوطنين من ناحية ومضايقات جيش الاحتلال من ناحية أخرى.