مع وصول أنباء قرب جنود الاحتلال نحو أراضي عيلبون، تجمع أهالي القرية في الكنسية ورفعوا الأعلام البيضاء، ورغم ذلك لم يشفع لسكان القرية ما حصله بهم عقب ذلك، إذ دخل جنود الاحتلال واختار "حاييم بطاطا" 12 شاباً من شباب القرية بشكل عشوائي، ثم اختار اثنين آخرين وأطلقوا عليهم النار بدم بارد.

ووفقاً لروايات كبار السن من أبناء عيلبون الشاهدين على الحدث، أن الصهاينة كانوا يريدون قتل 50 رجلاً آخرين، لكن حال دون ذلك دفع رجل من القرية اسمه "ابراهيم حوا" 100 ليرة فلسطينية لجنود الاحتلال.

لم يخلوا الأمر من إطلاق للنار على السكان العزل، فجرح عدد كبير من أبناء القرية، فيما اعتقل الصهاينة حوالي 40 رجلاً من أبناء القرية، ليطردوا من بقي من سكان القرية باتجاه قرية المغار المجاورة ومنها إلى الحدود اللبنانية.

هذه أسماء شهداء تلك المجزرة:

1. عبد الله سمعان شوفاني
2. فضل فضلو عيلبوني
3. فؤاد نوفل زريق
4. ميلاد فياض سليمان
5. ميخائيل متري شامي
6. نعيم غنطوس زريق
7. محمد خالد أسعد 
8. بديع جريس زريق
9. رجا مخايل خليل نخلة
10. جريس شبلي حايك
11. زكي موسى نخلة إسكافي 
12. حنا إبراهيم خوري أشقر 
13. عازر سالم مسلم
14. سمعان جريس شوفاني